Medicinoje kūno temperatūros matavimas yra labai svarbus. Daugelį ligų lydi padidėjusi kūno temperatūra. Temperatūra ir jos kitimas parodo ligos eigą bei gydymo efektyvumą.

Karščiavimas yra organizmo atsakas į specifinius karščiavimą sukeliančius stimulus. Organizmas keičia temperatūrą siekdamas suaktyvinti apsauginius mechanizmus.

Išmatuota kūno temperatūra priklauso nuo kūno vietos, kurioje ji buvo matuota. Priešingai visuotinai paplitusiai nuomonei, nėra tokio dalyko kaip "normali temperatūra".

Sveiko žmogaus kūno temperatūra kinta priklausomai nuo fizinės veiklos. Pvz., matuojant rektaliai vakarinio matavimo rezultatas būna 0.5 laipsio didesnis, nei kitu paros metu pamatuota temperatūra. Taip yra dėl fiziologinių priežasčių, tačiau dėl intensyvios fizinės veiklos šis skirtumas gali būti dar didesnis.

Svarbu skirti šiuos dalykus:

• Šerdinė temperatūra gaunama įvedus termometrą į kūno ertmes ir matuojant  gleivinių temperatūrą.
• Paviršiaus temperatūra gaunama matuojant odos paviršiaus temperatūrą.Ši priklauso nuo aplinkos temperatūros.